自学考试考生自通过本科毕业论文的登记审核，即进入到毕业论文的写作程序当中来。在进行登记时，会告诉每个专业的考生，在规定的时间去指定的地点听论文的讲座。在讲座上，高校主管该专业论文的老师会和大家见面，并根据大家的选题方向，将考生分配到有关的教研室，然后由教研室具体指派导师。
论文答辩的程序基本由三项组成：首先考生简单地阐述论文的写作动机、内容梗概和基本的观点；然后答辩小组成员就考生论文内容进行提问；如果答辩小组认为必要，还会对涉及论文的专业范围内的其他问题加以提问。这些提问都需要考生认真加以回答，并会影响到考生的论文成绩。考生通过论文答辩后，其本科论文即告完成。如果顺利通过，考生就应该准备本科毕业了。
毕业时间：上半年6月上旬，下半年12月上旬，具体时间向当地自考办咨询。
参加高等教育自学考试的考生，具备下列条件，方可参加毕业审查，办理自学考试毕业证书。
1、考完本专业考试计划所规定的理论课程且考试成绩合格。
2、完成该专业所规定的实践性环节课程考核，并取得合格成绩。
3、思想品德经鉴定符合要求。
4、办理本科毕业证书者，必须具有国家承认学历的专科及以上毕业证书。
上海自考毕业程序：
考生将本人准考证、身份证以及全部单科合格证书交当地自考办初审，经初审合格后发给《毕业生登记表》。
《毕业生登记表》由考生本人填写，所在单位（非在职人员由街道办事处或乡人民政府）签署意见后，于规定日期送交当地自学考试办公室报所在市自学考试工作委员会和省考委审核。
考生填写《毕业生登记表》不得隐瞒和造假，不得擅自涂改，违者将予以严肃处理，直至取消毕业资格；审核合格者，由省、自治区、直辖市考委颁发相应的毕业证书，主考学校在毕业证书上副署。
毕业生的有关档案材料由省自学考试办公室送毕业生所在单位组织、人事或劳动部门存入本人档案。
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